简单实现python多进程

在处理特别大的数据的时候,尤其是多重循环。例如对2万个基因进行一个计算,每个基因的计算需要进行1亿次比较。仅仅使用一个主进程进行计算就显得十分吃力;于是学习了python多进程的的处理,极大的缩短了脚本的运行时间。

小猪
  • 首先根据进程数,来分配任务
  • 将所有的进程加入进程池
  • 启动多个进程任务时,阻塞当前主进程
  • 待多进程任务完成后,在主进程中将结果输出

分配任务

  • ProcessNum从命令行从获取进程数
  • 根据进程数,平均分配任务给每个进程;最后一个进程负责除不尽的任务
  • p.apply_async给每个进程指定调用的函数和参数
  • p.close()所有进程任务指定完毕,开始执行进程任务
  • p.join()阻塞主进程,等待子进程任务完成
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import multiprocessing
with open(args.AS, 'r') as File:
data = File.readlines()
ProcessNum = int(args.p)
average = int(len(data)/ProcessNum)
p = multiprocessing.Pool(16)
for processId in range(0, ProcessNum):
if processId == ProcessNum-1:
start = processId*average
end = len(data)
else:
start = processId*average
end = (processId+1)*average
out.append(p.apply_async(mulProcessPSI,
(data[start:end], processId+1)))
p.close()
p.join()

获取进程结果

  • out数组中存着每个进程计算的结果
  • get()对每个进程调用get方法获得结果
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with open(args.o, 'w') as File:
for result in out:
for item in result.get():
File.write(item)

运行结果

仍需学习的

  • 多个进程进行文件写入时,涉及谁先写,谁后写的问题;需要使用到文件锁
  • 进程间通信问题
  • 内存溢出问题,多个进程的结果合并后太大了

参考

  1. https://zhuanlan.zhihu.com/p/64702600
  2. https://www.cnblogs.com/jiangfan95/p/11439207.html
------ 本文结束 thankyou 感谢阅读 ------

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